1959 yılında Kahramanmaraş’ın Andırın ilçesinde doğdu. 1979 yılında Adana İmam-Hatip Lisesi’ni bitirdi. Afyonkarahisar’ın Dazkırı ilçesi Karaağaç kuyusu Köyü Camii İmam-Hatipliğine atandı. Aynı yıl Erzurum Yüksek İslâm Enstitüsü’nü kazandı. Yüksek İslâm Enstitülerinin İlahiyat Fakültelerine dönüştürülmesi üzerine eğitim ve öğretimine Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde devam etti ve 1983 yılında fakülteyi başarı ile bitirdi.
Aynı yıl Diyanet İşleri Başkanlığının açtığı Müftülük-Vaizlik sınavını kazanarak 27.05.1984 tarihinde Elazığ İl Müftü Yardımcısı olarak göreve başladı. 19.08.1993-18.08.1999 tarihleri arasında altı yıl Adana İl Müftü Yardımcılığı görevinde bulundu. 19.08.1999-08.11.2001 tarihleri arasında Adana İl Müftüsü Vekilliği görevini yürüttü. 09.11.2001-25.01.2008 tarihleri arası Malatya İl Müftülüğü görevini yaptı. 01.02.2008-31.01.2011 tarihleri arasında 3 yıl süre ile T.C. Moskova Büyükelçiliği Din Hizmetleri Müşavirliği görevini yürüttü. Yurt dışı dönüşü kısa süreli başkanlık vaizliğinde bulundu. 16.05.2011 tarihinde Kırıkkale İl Müftülüğü görevine başladı ve bu görevi 5 yıl 8 ay yürüttü. 06 Aralık 2016 tarihli üçlü kararname ile de Eskişehir İl Müftülüğüne atandı. 23.01.2017 tarihinde Eskişehir İl Müftülüğü görevine başladı ve 04.07.2024 tarihinde yaş haddinden Eskişehirden emekli oldu
Bekir GEREK evli ve 4 çocuk babasıdır.